Setelah itu, dia didapuk sebagai komandan Kopassus. Dua tahun di pasukan elite itu, Doni Monardo dipromosikan menjadi Panglima Kodam Pattimura dan Pangdam Siliwangi.
Lalu, pada tahun 2018, ia ditarik menjadi Sekretaris Jenderal Dewan Ketahanan Nasional (Wantanas) dengan kenaikan pangkat Letnan Jenderal TNI.
Setelah sempat digadang-gadang menjadi Kepala Staf TNI Angkatan Darat (Kasad), pada awal 2019 jenderal bintang tiga ini kembali disebut-sebut akan menduduki jabatan baru sebagai Kepala Badan Nasional Penanggulangan Bencana (BNPB). Sempat tertunda, akhirnya Doni dilantik juga oleh Presiden Jokowi, pada Rabu (9/1/2019).
Berikut karier Letjen (Purn) Doni Monardo yang tutup usia pada Minggu (3/12/2023) : Danyon-11 grup-1/Kopassus, Danyonif 900/Raider (1999-2001), Dandema Paspampres, Waasops Danpaspampres, Danbrigif Linud 3/Tri Budi Sakti (2008), Dan Grup A Paspampres (2008-2010), Danrem 061/Surya Kencana (2010-2011), Wadanjen Kopassus (2011-2012), Danpaspampres (2012-2014), Danjen Kopassus (2014-2015), Pangdam XVI/Pattimura (2015-2017), Pangdam III/Siliwangi (2017-2018), Sekretaris Jenderal Wantannas (2018-2019), Kepala Badan Nasional Penanggulangan Bencana (BNPB) (2019-2021), dan Ketua Umum Persatuan Purnawirawan TNI Angkatan Darat (PPAD) periode 2021-2026. (hk01)